段位三作业1

1.分子互作分析
1)以GSE101685为例,分析该数据集的差异表达基因,筛选标准为:adj.P.Val<0.05且logFC绝对值>1。

2)针对以上筛选的差异表达基因使用String数据库构建PPI蛋白-蛋白互作网络图,本题要求可信度大于0.900。
【选择文件】(5MB以内)
2.分子网络构建
1)使用Cytoscape软件中的MCODE插件对上述差异表达基因进行进一步分析,筛选出Hub基因。

2)使用“ClueGO+Cluepedia”插件对上述分数最高的一组Hub基因进行GO富集分析。
【选择文件】(5MB以内)

1题 | 被引用0次

模板修改
使用此模板创建