段位一作业2

以下4题为生信体系课段位一第3/4模块对应的作业,可选做其中2题,下周一群内讲解答案~
测序数据下载:

1)下载TCGA数据库中肝细胞癌的转录本FPKM数据;

2)下载TCGA数据库中肝细胞癌的临床数据;
【选择文件】(5MB以内)
测序数据差异表达分析:(选做题,由于BioJupies网站最近经常无法上传文件,而该网站使用较为简单,只需点击3个地方,关键在于上传的数据准备,现提供两个题目及一份可以直接上传的数据给大家作为示范,大家根据自己网速选择是否完成该作业)

1)请使用BioJupies网站对data2数据进行PCA分析,并将PCA结果提交

2)请使用BioJupies网站对data2数据进行差异分析,并提交差异基因的火山图及热图。(data2数据见群内附件)
【选择文件】(5MB以内)

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